小儿外科成立于1981年，是我院创始科室之一，当时床位15张，专科医师5名，现学科拥为有专科病床135张，2013年12月成立儿童外科学系。除小儿心胸外科、小儿骨科和小儿神经外科单独设科外，小儿外科又细分为小儿普外、小儿泌尿、新生儿外科等亚专科，并有专门的儿童ICU、新生儿ICU和儿童急诊室，临床诊治能力和技术水平有了极大的提高。该学科现每年完成住院手术约3500余例，门诊及日间手术2000余例，年门诊量近8万人次，是浙南、闽北地区的小儿外科疾病临床诊疗中心。

小儿外科学是浙江省医学重点支撑学科、温州医科大学重点建设学科，目前是浙江省医学会小儿外科分会主任委员单位。学科成员还担任了中华医学会小儿外科学分会委员及肿瘤、肛肠等专业组副组长和委员，中国抗癌协会小儿肿瘤专业委员会常委，浙江省抗癌协会小儿肿瘤专业委员会副主任委员；同时也是《中华小儿外科杂志》和《临床小儿外科杂志》编委，及《儿童实体肿瘤诊疗指南》副主编、儿科专业全国统编教材《小儿外科学》编委。

学科目前拥有专科医师30余人，其中教授或主任医师6人，硕（博）士研究生导师6名，副教授或副主任医师10名，博士学位6人。儿童外科学系承担着温州医科大学临床医学儿科专业方向小儿外科本科教学工作；2001年起招收硕士研究生，是国家卫生部小儿外科专科医师培训试点基地及浙江省首批小儿外科住院医师规范化培训基地。

系主任：李仲荣   系副主任  赵琦峰

系主任助理： 张敬东 朱利斌

（更新于2018年8月）